Skripsi
KEKERABATAN GENETIK IKAN TAWES (Barbonymus gonionotus) ASAL SUNGAI OGAN DAN SUNGAI KELEKAR BERDASARKAN GEN SITOKROM C OKSIDASE SUBUNIT 1 (CO1)
Genus barbonymus memiliki empat spesies yang tersebar di perairan Pulau Jawa, Kalimantan, dan Sumatera. Salah satunya adalah ikan tawes yang dikenal dengan nama bader putihan, Barbonymus gonionotus. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui sekuen gen sitokrom C oksidase subunit 1 DNA mitokondria ikan tawes, mengetahui jarak genetik, filogenetik antar spesies ikan tawes dan kualitas air asal Sungai Ogan dan Sungai Kelekar. Penelitian ini telah dilaksanakan pada bulan Oktober 2023-Februari 2024. Metode yang digunakan dalam barcoding spesies ikan tawes yaitu isolasi DNA, amplifikasi DNA menggunakan PCR (Polymerase Chain Reaction), elektroforesis dan sekuensing daerah gen CO1 pada mtDNA. Fragmen gen COI mtDNA yang telah disekuensing didapatkan dari hasil PCR dengan suhu annealing 50,9℃ selama 30 detik dengan 31 siklus. Panjang nukleotida gen COI yang dihasilkan pada ikan tawes asal Sungai Ogan dan asal Sungai Kelekar berukuran 629 bp. Analisis BLASTn sampel ikan tawes asal Sungai Ogan dan Sungai Kelekar memiliki kemiripan sebesar 100% dengan spesies yang sama pada data Genbank. Filogenetik ikan tawes memiliki tiga cluster utama yaitu cluster pertama dan terdiri dari spesies Barbonymus gonionotus, cluster kedua terdiri dari spesies Hypsibarbus malcolmi, Hypsibarbus wetromei, Poropuntius opisthoptera, Poropuntius laoensis sedangkan cluster yang ketiga terdiri dari spesies outgroup yaitu Puntius tetrazona. Hasil pengukuran kualitas air dari Sungai Ogan dan Sungai Kelekar selama penelitian yaitu suhu 29,2-31,8℃, oksigen terlarut 3,4-6,9 mg L-1, TDS 0,04-0,013 mg L-1, pH 5,5-6,7, kecerahan 45-80 cm dan amonia 0,09-0,20 mg L-1.
| Title | Edition | Language |
|---|---|---|
| KEBIASAAN MAKANAN SERTA HUBUNGAN PANJANG-BERAT IKAN TAWES (Batbodes gonionotus Blkr.) DI WADUK GAJAH MUNGKUR, JAWA TENGAH | id |