Skripsi

EVALUASI IN SILICO POTENSI ANTIOKSIDAN SENYAWA AKTIF DALAM EKSTRAK BUAH BIT (Beta vulgaris L.) MELALUI PENDEKATAN MOLECULAR DOCKING

---

Stres oksidatif berperan penting dalam patogenesis berbagai penyakit degeneratif melalui pembentukan radikal bebas. Buah bit (Beta vulgaris) diketahui mengandung senyawa bioaktif yang berpotensi sebagai antioksidan alami. Penelitian ini bertujuan untuk mengeksplorasi potensi senyawa aktif dalam ekstrak metanol buah bit sebagai inhibitor enzim pembentuk radikal bebas melalui pendekatan molecular docking. Identifikasi senyawa aktif dilakukan menggunakan data GC-MS, kemudian dianalisis interaksinya terhadap protein target stres oksidatif, yaitu Superoxide Dismutase (SOD, PDB ID: 1CB4) dan Glutathione Peroxidase (GPx, PDB ID: 2P31), menggunakan perangkat lunak AutoDock Vina dan divisualisasikan melalui Discovery Studio. Parameter utama yang dianalisis meliputi nilai binding affinity, jenis ikatan, dan residu asam amino yang berinteraksi. Tujuh senyawa aktif utama teridentifikasi dari ekstrak buah bit, yaitu Pterin-6-carboxylic acid, Ethyl-Cholate, 9,12-Octadecadienoic acid (Z,Z)-, 4H-Pyran-4-one, 2,3-dihydro-3,5-dihydroxy-6-methyl, Desulphosinigrin, dan Geraniol. Hasil docking menunjukkan bahwa senyawa Pterin-6-carboxylic acid memiliki nilai binding affinity terbaik di antara senyawa uji dengan nilai −5,597 kcal/mol terhadap reseptor SOD (1CB4) dan −4,13 kcal/mol terhadap GPx (2P31), yang mendekati kuersetin sebagai senyawa pembanding (−5,639 dan −4,788 kcal/mol). Secara interaksi, senyawa uji membentuk ikatan hidrogen dan hidrofobik yang melibatkan residu penting pada binding site enzim target. kuersetin memiliki nilai afinitas yang lebih rendah secara numerik, senyawa uji dari buah bit menunjukkan pola interaksi residu yang kompleks dan relevan, seperti ikatan pi-alkyl, pi-pi T-shaped, dan pi-sulfur, yang berkontribusi terhadap kestabilan ikatan ligan–reseptor. Studi ini memberikan dasar ilmiah yang kuat bagi pengembangan fitoterapi alami dalam pengelolaan stres oksidatif dan penyakit terkait. Kata kunci: Buah Bit, Ikatan Afinitas, Residu Asam Amino, Stres Oksidatif

---

Availability

Detail Information

Series Title

-

Call Number

T1920342026

Publisher

Indralaya : Prodi Farmasi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Sriwijaya., 2026

Collation

xv, 42 hlm.; ilus.; 29 cm

Language

Indonesia

ISBN/ISSN

-

Classification

615.190 7

Content Type

Text

Media Type

-

Carrier Type

-

Edition

-

Subject(s)

Kimia Farmasi
Prodi Farmasi

Specific Detail Info

-

Statement of Responsibility

TUTI

Other version/related

File Attachment

Comments

---

You must be logged in to post a comment